Ce dépôt contient les supports de cours de l'École de Bioinformatique Inserm - IFB - INRAe "Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit" (niveau intermédiaire).
L'École de Bioinformatique Inserm - IFB - INRAe (EBIII) propose plusieurs formations en bioinformatique, notamment :
- Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit (niveaux débutant et intermédiaire)
- Assemblage et annotation de génomes procaryotes et eucaryotes
Les formations alternent entre sessions théoriques et ateliers pratiques. Les participants bénéficient d'un tutorat personnalisé pour les aider à élaborer leur plan d'analyse et à réaliser les premières étapes du traitement de leurs propres données ou de celles de leur équipe.
⚠ Le tutorat ne vise pas à réaliser une analyse complète des données des participants.
- Langue : Les cours sont donnés uniquement en français.
- Lieu : Roscoff (Hôtel de France)
- Public visé : Biologistes (ingénieurs, doctorants, chercheurs, enseignants-chercheurs, praticiens...) confrontés à l'analyse de données NGS et souhaitant acquérir ou renforcer leurs compétences en bioinformatique.
- Frais d'inscription :
- 1000€ HT pour les académiques et EPIC
- 2500€ HT pour les industriels
- L'hébergement et la restauration sont inclus.
- Les frais de transport restent à la charge des participants.
L'école propose trois ateliers thématiques en session parallèle :
- RNA-seq
- ChIP-seq
- Variants DNA-seq
La formation inclut également la visualisation et l'intégration des données.
- Utilisation de la ligne de commande sous Linux (terminal)
- Analyse des données avec le langage R
Les candidats doivent avoir acquis les compétences enseignées durant l'école de niveau débutant, notamment :
- Bases de la ligne de commande Linux
- Initiation à R
- Expérience avec au moins une des analyses suivantes : RNA-seq, ChIP-seq ou variants DNA-seq
📅 1 au 6 juin 2025
📌 Demande d'inscription (clôture : 7 juin 2025)