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您好,我在阅读您的论文过程中,对您的实验结果呈现表格中一些地方有困惑,希望您的帮助解答,十分感谢!
具体是:在您的论文主实验表格中,对比了不同模型方法生成配体分子的各个指标:vina_score\vina_min\vina_dock\qed\high_affinity\sa\diversity。
对每个指标,您计算了avg\med两种模式下的指标值。
我的问题是:您的这两种模式具体计算方式是什么?
对于vina_dock中的avg和med值,是下列两种方式的哪一种?
①分别计算crossdocked2020数据集中每个生成的配体分子的vina_dock指标,然后对这些vina_dock求平均数和中位数。
还是
②对于每个生成的配体分子,多次计算其vina_dock指标,求出多次对接的中位数和平均数。再把每个配体分子vina_dock的平均数和中位数进行平均得出总体的vina_dock平均数和中位数。
十分感谢您的回复!
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